ईश्वरप्पा ने राजनीति से संन्यास लेने का ऐलान कर दिया था और बेटे को हावेरी से टिकट देने की मांग की थी. लेकिन ऐसा न होने पर वह बागी हो गए और निर्दलीय चुनाव में उतरने का फैसला कर डाला. उन्होंने बीजेपी नेता और पूर्व सीएम बीएस येदियुरप्पा के खिलाफ अपनी नाराजगी जाहिर की. वह लोकसभा चुनाव के तीसरे चरण में येदियुरप्पा के बेटे बीवाई राघवेंद्र के खिलाफ चुनाव लड़ेंगे.
बीजेपी ने कर्नाटक के बागी नेता केएस ईश्वरप्पा पर एक्शन लिया है. कर्नाटक बीजेपी ने पार्टी के दिग्गज नेता से बागी बने केएस ईश्वरप्पा को 6 साल के लिए पार्टी से निष्कासित कर दिया है. ईश्वरप्पा ने अपने बेटे को हावेरी से लोकसभा टिकट नहीं दिए जाने से नाराज होकर शिवमोगा से निर्दलीय चुनाव लड़ने का ऐलान करते हुए नामांकन कर दिया है. यही कारण है कि अब पार्टी ने उनके खिलाफ कार्रवाई की है. चुनाव आयोग से ईश्वरप्पा को निर्दलीय उम्मीदवार के रूप में गन्ना किसान चुनाव चिन्ह मिला है.